日本統計研究所は以下の体制で運営しております。
所長及び所員（2021年度）
| 所長 | ||||
|---|---|---|---|---|
| 菅 幹雄 | 法政大学経済学部教授 | |||
| 所員 | ||||
| 坂本 憲昭 | 法政大学経済学部教授 | 牧野 文夫 | 法政大学経済学部教授 | |
| 阿部 俊弘 | 法政大学経済学部教授 | 岡田 栄作 | 法政大学現代福祉学部准教授 | |
| 中村 洋一 | 法政大学理工学部教授 | 北浦 康嗣 | 法政大学社会学部教授 | |
| 名誉研究員 | ||||
| 伊藤 陽一 | 法政大学名誉教授 | 森 博美 | 法政大学名誉教授 | |
| 客員研究員 | ||||
| 坂田 幸繁 | 中央大学経済学部教授 | 山本 健兒 | 帝京大学経済学部教授 | |
| 御園 謙吉 | 阪南大学経営情報学部教授 | 高橋 朋一 | 青山学院大学経済学部教授 | |
| 水野谷武志 | 北海学園大学経済学部教授 | 宮川 幸三 | 立正大学経済学部教授 | |
| 長谷川普一 | 新潟市都市政策部GISセンター主幹 | 杉橋やよい | 専修大学経済学部教授 | |
| 栗原由紀子 | 立命館大学経済学部准教授 | 小野寺 剛 | 環太平洋大学経営学部准教授 | |
| 宮内 環 | 慶応義塾大学経済学部准教授 | |||